Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
TRIM72Q6ZMU5 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms