Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 ABI1-213ENST00000536334 3380 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AOC4P-203ENST00000566825 2289 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CXCL5-201ENST00000296027 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ELN-216ENST00000429192 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 WDR24-201ENST00000248142 2763 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 FCGR3A-206ENST00000443193 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
C16orf54Q6UWD8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms