Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 MIR663B-201ENST00000408361 115 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ANKRD54Q6NXT1 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ANKRD54Q6NXT1 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms