Protein–RNA interactions for Protein: Q5FBB7

SGO1, Shugoshin 1, humanhuman

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Length 561 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGO1Q5FBB7 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SGO1Q5FBB7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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SGO1Q5FBB7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SGO1Q5FBB7 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
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