Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 SYN1-201ENST00000295987 3299 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
RPL39P5Q59GN2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms