Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC011477.6-201ENST00000604980 1927 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL12Q53G59 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.3 ms