Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC020915.1-201ENST00000413518 1469 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SLC39A12Q504Y0 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms