Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
FOXD4L6Q3SYB3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4L6Q3SYB3 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4L6Q3SYB3 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4L6Q3SYB3 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4L6Q3SYB3 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4L6Q3SYB3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4L6Q3SYB3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4L6Q3SYB3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXD4L6Q3SYB3 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms