Protein–RNA interactions for Protein: Q2M1V0

ISX, Intestine-specific homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ISXQ2M1V0 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ISXQ2M1V0 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms