Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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GEN1Q17RS7 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
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GEN1Q17RS7 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
GEN1Q17RS7 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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