Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CCDC142Q17RM4 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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