Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NDUFA9Q16795 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NDUFA9Q16795 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NDUFA9Q16795 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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NDUFA9Q16795 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NDUFA9Q16795 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NDUFA9Q16795 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NDUFA9Q16795 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NDUFA9Q16795 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NDUFA9Q16795 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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NDUFA9Q16795 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
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NDUFA9Q16795 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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NDUFA9Q16795 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NDUFA9Q16795 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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