Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
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SYPL1Q16563 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SYPL1Q16563 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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SYPL1Q16563 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SYPL1Q16563 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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