Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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PCSK7Q16549 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PCSK7Q16549 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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