Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PDCD2Q16342 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ROCK1-201ENST00000399799 9484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 HNRNPU-201ENST00000283179 3120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PDCD2Q16342 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms