Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

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Length 398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
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CYTH1Q15438 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
CYTH1Q15438 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
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