Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRIM29Q14134 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TRIM29Q14134 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms