Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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CNGB1Q14028 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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CNGB1Q14028 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
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CNGB1Q14028 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
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CNGB1Q14028 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
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CNGB1Q14028 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CNGB1Q14028 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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