Protein–RNA interactions for Protein: Q13888

GTF2H2, General transcription factor IIH subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H2Q13888 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
GTF2H2Q13888 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms