Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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ITGA9Q13797 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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ITGA9Q13797 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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ITGA9Q13797 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
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ITGA9Q13797 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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ITGA9Q13797 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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ITGA9Q13797 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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ITGA9Q13797 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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ITGA9Q13797 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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ITGA9Q13797 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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ITGA9Q13797 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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ITGA9Q13797 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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ITGA9Q13797 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ITGA9Q13797 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
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ITGA9Q13797 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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