Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 SLC25A19-205ENST00000442286 1496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
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SHROOM2Q13796 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AL157792.1-201ENST00000488281 530 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
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SHROOM2Q13796 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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SHROOM2Q13796 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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SHROOM2Q13796 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
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SHROOM2Q13796 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SHROOM2Q13796 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
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SHROOM2Q13796 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
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SHROOM2Q13796 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SHROOM2Q13796 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
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