Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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HTR4Q13639 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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HTR4Q13639 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HTR4Q13639 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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