Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TCIRG1Q13488 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 ARHGEF26-AS1-201ENST00000467912 628 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
TCIRG1Q13488 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
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