Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPA4Q13156 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPA4Q13156 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms