Protein–RNA interactions for Protein: Q12887

COX10, Protoheme IX farnesyltransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX10Q12887 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
COX10Q12887 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 TET2-207ENST00000513237 10166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 TET2-209ENST00000540549 10166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
COX10Q12887 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COX10Q12887 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COX10Q12887 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COX10Q12887 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COX10Q12887 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COX10Q12887 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COX10Q12887 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COX10Q12887 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COX10Q12887 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
COX10Q12887 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COX10Q12887 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COX10Q12887 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COX10Q12887 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COX10Q12887 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COX10Q12887 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COX10Q12887 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
COX10Q12887 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms