Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CNTN1Q12860 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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CNTN1Q12860 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CNTN1Q12860 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CNTN1Q12860 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CNTN1Q12860 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CNTN1Q12860 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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CNTN1Q12860 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CNTN1Q12860 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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