Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TROQ12816 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TROQ12816 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TROQ12816 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TROQ12816 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
TROQ12816 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TROQ12816 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TROQ12816 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TROQ12816 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TROQ12816 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TROQ12816 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TROQ12816 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TROQ12816 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TROQ12816 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TROQ12816 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TROQ12816 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TROQ12816 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TROQ12816 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TROQ12816 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TROQ12816 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TROQ12816 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TROQ12816 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
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