Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ADCY7-208ENST00000566433 2535 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CCDC173Q0VFZ6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms