Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RBBP4Q09028 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms