Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GOLGA3Q08378 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms