Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABPAQ06546 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms