Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PTPN11Q06124 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms