Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RNF148-201ENST00000434824 1304 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MCEE-201ENST00000244217 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 LINC01114-201ENST00000421071 482 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 VDAC1P12-201ENST00000451853 882 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CCDC58-205ENST00000479899 545 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 LINC01259-201ENST00000507056 757 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC105999.2-203ENST00000521030 663 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC007906.1-201ENST00000568648 510 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL133406.3-201ENST00000606817 541 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AL358975.1-202ENST00000628133 589 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MAPK10-350ENST00000641777 965 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
TNP2Q05952 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms