Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CENPCQ03188 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CENPCQ03188 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.2 ms