Protein–RNA interactions for Protein: Q01523

DEFA5, Defensin-5, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA5Q01523 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 AKAP2-203ENST00000434623 4400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 DDX31-204ENST00000372159 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 PI4KA-201ENST00000255882 6752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 ZNF202-206ENST00000529691 3384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
DEFA5Q01523 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms