Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
MDM2Q00987 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms