Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CDC42EP1Q00587 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms