Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC008743.1-201ENST00000596350 813 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
HTRA4P83105 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms