Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.98
RPS29P62273 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
RPS29P62273 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms