Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TXNRD3NB-202ENST00000383572 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ERVK-21P61565 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms