Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
RAD23AP54725 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms