Protein–RNA interactions for Protein: P49354

FNTA, Protein farnesyltransferase/geranylgeranyltransferase type-1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTAP49354 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FNTAP49354 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FNTAP49354 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
FNTAP49354 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms