Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPD2P43304 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
GPD2P43304 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPD2P43304 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPD2P43304 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPD2P43304 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPD2P43304 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPD2P43304 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPD2P43304 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
GPD2P43304 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
GPD2P43304 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
GPD2P43304 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPD2P43304 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPD2P43304 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPD2P43304 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPD2P43304 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPD2P43304 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPD2P43304 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPD2P43304 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPD2P43304 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPD2P43304 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPD2P43304 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPD2P43304 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPD2P43304 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPD2P43304 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPD2P43304 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPD2P43304 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPD2P43304 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
GPD2P43304 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms