Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
ATP5C1P36542 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
ATP5C1P36542 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms