Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TRIM23P36406 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
TRIM23P36406 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms