Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 OS9-207ENST00000439210 1946 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
DDIT3P35638 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms