Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
HOXA7P31268 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms