Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ATP4AP20648 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms