Protein–RNA interactions for Protein: P18564

ITGB6, Integrin beta-6, humanhuman

Predictions only

Length 788 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB6P18564 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ITGB6P18564 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms