Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEFHP12036 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEFHP12036 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEFHP12036 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEFHP12036 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEFHP12036 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEFHP12036 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEFHP12036 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
NEFHP12036 USP3-204ENST00000540797 5474 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
NEFHP12036 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 TNS2-202ENST00000314276 4944 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NEFHP12036 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NEFHP12036 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms